Kudo Shinichi, un lycéen reconnu comme détective prodige, et Mori Ran sont amis d'enfance. Mori Kogoro, le père de la jeune fille, est, lui, un détective privé. Ensemble, ils résolvent de nombreuses affaires, notamment de meurtres.

Jusqu'au jour où ils se réveillent tous les trois dans une salle sans issue. Enfermés entre quatre murs parfaitement blancs, ils font face à une console. Celle-ci leur indique une date. La date correspond à une de leurs enquêtes passées...
Ainsi, un mot de passe reste à trouver pour qu'ils puissent accéder à une autre salle. Lorsqu'ils l'ont trouvé, une porte s'ouvre vers une autre pièce parfaitement blanche présentant une autre console avec une autre date.

À chaque épisode correspond une pièce, une date et donc une enquête différente. Mais où les mènera cette chasse d'un nouveau genre?