Heidi est une petite fille dont les parents sont morts quand elle était bébé. Son éducation a été confiée à sa tante. Néanmoins, lorsque Heidi atteint l'âge de 6 ans, sa tante décide qu'elle s'est assez sacrifiée et qu'il est temps que l'autre parent d'Heidi prenne la relève. Elle emmène donc la fillette chez son grand-père, un étrange vieil homme qui vit dans les Alpes, dans un chalet isolé du hameau le plus proche. Surnommé l'Oncle de l'Alpe par les villageois, le vieil ermite est extrêmement bourru et ne fait confiance à personne. Néanmoins la petite fille parvient à l'amadouer grâce à son naturel, sa gentillesse, sa fraicheur, son dynamisme et son opiniâtreté. S'attachant de plus en plus à la fillette il s'emploie à la protéger contre toutes les mauvaises choses du monde. Ainsi il refuse d'envoyer Heidi à l'école. À la place elle suit Pierre (un jeune berger que le grand-père surnomme "Général") dans les pâturages avec ses chèvres. Cette vie trop idyllique et trop harmonieuse prend tout à coup fin lorsque la tante d'Heidi revient chercher la petite fille...