Sho et son ami Tetsuro découvrent dans la forêt un objet bizarre. En fait, il s'agit de l'unité Guyver. Celle-ci va fusionner avec le corps de Sho qui va apprendre à maîtriser cette armure très spéciale. Une entreprise multinationale, Chronos, est à l'origine de l'unité Guyver et est bien décidée à la récupérer à l'aide des Zoanoïds, d'énormes monstres dotés d'une force incroyable. Mais quel est le dessein de Chronos ? Quelle est l'origine du Guyver ?