Depuis sa mise à l'abandon, la Porte des Etoiles, une passerelle entre la Terre et les autres planètes, est étroitement surveillée par l'Armée de l'Air. Soudainement, elle s'active et une horde d'extraterrestres, les Goa'ulds, débarque et extermine le détachement de soldats en place. La seule survivante, un sergent, est emmenée de force sur leur planète d'origine : Abydos. Dépassé par les évènements, le Général Hammond rappelle d'urgence le Colonel Jack O'Neill pour qu'il reprenne du service. Le programme Stargate est alors relancé et la première équipe d'expédition, le commando SG-1, est paré pour sa mission de sauvetage.